Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18524 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18524 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18524 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18524 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18524 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18524 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18524 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18524 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18524 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
P18524 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
P18524 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18524 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18524 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18524 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18524 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18524 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
P18524 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
P18524 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18524 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
P18524 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
P18524 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
P18524 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
P18524 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18524 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18524 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
P18524 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18524 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18524 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18524 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18524 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18524 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18524 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
P18524 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18524 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18524 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18524 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18524 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18524 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18524 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
P18524 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18524 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18524 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18524 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18524 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18524 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18524 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18524 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
P18524 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.59
P18524 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18524 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18524 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18524 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P18524 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18524 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18524 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18524 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18524 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18524 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18524 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P18524 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18524 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18524 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P18524 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18524 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18524 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P18524 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P18524 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
P18524 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18524 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18524 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18524 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18524 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18524 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18524 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18524 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18524 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18524 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18524 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18524 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18524 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
P18524 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18524 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18524 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
P18524 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18524 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18524 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18524 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18524 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18524 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18524 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18524 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18524 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18524 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18524 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18524 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18524 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18524 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18524 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
P18524 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.3 ms