Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa1P11477 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa1P11477 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa1P11477 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa1P11477 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa1P11477 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa1P11477 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms