Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtaP09225 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
LtaP09225 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtaP09225 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtaP09225 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtaP09225 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
LtaP09225 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtaP09225 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtaP09225 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtaP09225 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtaP09225 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtaP09225 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtaP09225 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtaP09225 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
LtaP09225 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
LtaP09225 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtaP09225 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtaP09225 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
LtaP09225 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
LtaP09225 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
LtaP09225 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtaP09225 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtaP09225 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtaP09225 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtaP09225 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtaP09225 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtaP09225 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtaP09225 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtaP09225 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtaP09225 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtaP09225 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtaP09225 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtaP09225 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtaP09225 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
LtaP09225 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtaP09225 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtaP09225 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtaP09225 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtaP09225 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtaP09225 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtaP09225 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
LtaP09225 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtaP09225 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtaP09225 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtaP09225 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtaP09225 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtaP09225 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LtaP09225 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtaP09225 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtaP09225 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtaP09225 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtaP09225 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
LtaP09225 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtaP09225 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtaP09225 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtaP09225 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtaP09225 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtaP09225 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtaP09225 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtaP09225 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtaP09225 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtaP09225 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtaP09225 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtaP09225 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtaP09225 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtaP09225 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtaP09225 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtaP09225 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtaP09225 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtaP09225 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtaP09225 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtaP09225 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtaP09225 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtaP09225 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtaP09225 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtaP09225 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtaP09225 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtaP09225 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtaP09225 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
LtaP09225 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtaP09225 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
LtaP09225 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtaP09225 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtaP09225 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
LtaP09225 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
LtaP09225 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtaP09225 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
LtaP09225 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtaP09225 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtaP09225 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtaP09225 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtaP09225 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtaP09225 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtaP09225 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtaP09225 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtaP09225 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtaP09225 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtaP09225 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtaP09225 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtaP09225 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms