Protein–RNA interactions for Protein: P04942

Ig kappa chain V-VI region NQ5-61.1.2, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04942 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04942 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P04942 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04942 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04942 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04942 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04942 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04942 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04942 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04942 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04942 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04942 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04942 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04942 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04942 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04942 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04942 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04942 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04942 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04942 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04942 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04942 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P04942 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04942 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04942 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04942 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04942 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04942 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04942 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04942 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04942 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04942 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04942 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04942 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04942 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04942 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04942 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04942 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04942 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04942 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04942 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04942 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04942 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04942 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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P04942 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04942 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04942 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04942 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04942 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04942 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04942 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04942 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P04942 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04942 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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P04942 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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P04942 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04942 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P04942 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04942 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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P04942 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04942 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04942 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04942 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04942 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04942 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04942 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04942 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04942 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04942 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04942 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04942 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04942 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04942 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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P04942 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04942 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04942 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P04942 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P04942 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P04942 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P04942 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P04942 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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P04942 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P04942 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P04942 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P04942 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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P04942 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
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