Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04214 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P04214 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04214 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04214 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04214 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04214 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P04214 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04214 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04214 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04214 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P04214 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04214 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04214 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04214 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04214 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04214 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04214 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04214 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04214 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04214 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04214 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04214 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04214 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04214 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P04214 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04214 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04214 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P04214 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04214 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04214 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04214 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04214 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04214 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04214 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04214 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04214 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04214 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04214 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P04214 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04214 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P04214 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04214 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P04214 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04214 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04214 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04214 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04214 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04214 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04214 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P04214 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04214 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04214 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04214 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04214 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04214 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04214 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04214 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04214 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04214 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04214 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04214 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P04214 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04214 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04214 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04214 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04214 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04214 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04214 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04214 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04214 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04214 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04214 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04214 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04214 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04214 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P04214 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04214 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04214 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04214 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P04214 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P04214 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04214 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04214 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04214 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P04214 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P04214 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04214 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04214 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04214 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04214 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P04214 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P04214 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04214 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P04214 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04214 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04214 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04214 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04214 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P04214 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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