Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P04212 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P04212 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P04212 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P04212 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P04212 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P04212 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P04212 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P04212 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P04212 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P04212 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P04212 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P04212 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P04212 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P04212 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P04212 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P04212 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P04212 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P04212 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P04212 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P04212 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P04212 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P04212 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P04212 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P04212 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P04212 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
P04212 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P04212 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P04212 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
P04212 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P04212 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P04212 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P04212 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P04212 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P04212 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P04212 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P04212 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P04212 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P04212 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P04212 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P04212 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P04212 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P04212 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P04212 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P04212 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P04212 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P04212 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P04212 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P04212 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P04212 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P04212 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P04212 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P04212 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P04212 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P04212 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P04212 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P04212 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P04212 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P04212 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P04212 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P04212 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P04212 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P04212 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P04212 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P04212 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P04212 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P04212 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P04212 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P04212 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P04212 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P04212 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P04212 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P04212 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P04212 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P04212 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P04212 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P04212 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P04212 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P04212 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P04212 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P04212 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P04212 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P04212 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P04212 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P04212 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P04212 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P04212 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P04212 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P04212 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P04212 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P04212 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P04212 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P04212 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P04212 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P04212 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P04212 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P04212 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P04212 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P04212 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P04212 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms