Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

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Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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H2-Ab1P01921 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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H2-Ab1P01921 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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H2-Ab1P01921 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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