Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Ccl20O89093 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
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Ccl20O89093 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Ccl20O89093 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Ccl20O89093 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Ccl20O89093 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Ccl20O89093 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Ccl20O89093 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Ccl20O89093 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Ccl20O89093 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Ccl20O89093 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ccl20O89093 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ccl20O89093 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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