Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CopeO89079 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CopeO89079 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CopeO89079 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CopeO89079 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CopeO89079 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CopeO89079 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CopeO89079 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CopeO89079 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CopeO89079 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CopeO89079 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CopeO89079 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CopeO89079 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CopeO89079 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CopeO89079 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CopeO89079 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CopeO89079 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CopeO89079 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CopeO89079 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CopeO89079 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CopeO89079 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CopeO89079 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CopeO89079 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CopeO89079 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CopeO89079 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CopeO89079 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CopeO89079 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CopeO89079 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CopeO89079 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CopeO89079 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CopeO89079 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CopeO89079 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CopeO89079 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CopeO89079 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CopeO89079 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CopeO89079 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CopeO89079 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CopeO89079 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CopeO89079 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CopeO89079 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CopeO89079 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CopeO89079 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CopeO89079 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CopeO89079 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CopeO89079 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CopeO89079 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CopeO89079 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CopeO89079 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CopeO89079 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CopeO89079 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CopeO89079 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CopeO89079 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CopeO89079 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CopeO89079 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CopeO89079 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CopeO89079 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CopeO89079 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CopeO89079 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CopeO89079 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CopeO89079 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CopeO89079 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CopeO89079 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CopeO89079 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CopeO89079 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CopeO89079 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CopeO89079 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CopeO89079 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CopeO89079 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CopeO89079 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CopeO89079 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CopeO89079 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CopeO89079 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CopeO89079 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CopeO89079 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CopeO89079 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CopeO89079 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CopeO89079 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CopeO89079 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CopeO89079 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CopeO89079 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CopeO89079 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CopeO89079 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
CopeO89079 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CopeO89079 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CopeO89079 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CopeO89079 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CopeO89079 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CopeO89079 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CopeO89079 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CopeO89079 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CopeO89079 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CopeO89079 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CopeO89079 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CopeO89079 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CopeO89079 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CopeO89079 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CopeO89079 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CopeO89079 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CopeO89079 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CopeO89079 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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