Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Dgcr6O35347 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms