Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Usp9yF8VPU6 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Usp9yF8VPU6 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Usp9yF8VPU6 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Usp9yF8VPU6 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Usp9yF8VPU6 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Usp9yF8VPU6 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Usp9yF8VPU6 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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