Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm28048F7BCN0 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms