Protein–RNA interactions for Protein: E9QLQ1

Defa35, Defensin, alpha, 35, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa35E9QLQ1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa35E9QLQ1 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms