Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ddx60E9PZQ1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms