Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc175E9PVB3 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms