Protein–RNA interactions for Protein: D3YYP3

Gm6685, Predicted pseudogene 6685, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6685D3YYP3 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm6685D3YYP3 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms