Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm6133B2RY53 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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