Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Prrt4B2RU40 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms