Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rrn3B2RS91 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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