Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NhsB1AV60 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms