Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Rtf1A2AQ19 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Rtf1A2AQ19 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Rtf1A2AQ19 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Rtf1A2AQ19 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Rtf1A2AQ19 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Rtf1A2AQ19 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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Rtf1A2AQ19 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Rtf1A2AQ19 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Rtf1A2AQ19 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Rtf1A2AQ19 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Rtf1A2AQ19 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rtf1A2AQ19 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms