Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Syndig1A2ANU3 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms