Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GabreA2AMW3 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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