Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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