Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5538W4VSP6 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms