Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Top3bQ9Z321 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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