Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac6Q9Z2V5 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac6Q9Z2V5 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac6Q9Z2V5 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac6Q9Z2V5 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac6Q9Z2V5 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac6Q9Z2V5 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac6Q9Z2V5 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac6Q9Z2V5 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac6Q9Z2V5 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac6Q9Z2V5 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac6Q9Z2V5 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac6Q9Z2V5 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac6Q9Z2V5 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hdac6Q9Z2V5 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Hdac6Q9Z2V5 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Hdac6Q9Z2V5 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Hdac6Q9Z2V5 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Hdac6Q9Z2V5 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Hdac6Q9Z2V5 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Hdac6Q9Z2V5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Hdac6Q9Z2V5 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hdac6Q9Z2V5 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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