Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Trim44Q9QXA7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Trim44Q9QXA7 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Trim44Q9QXA7 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim44Q9QXA7 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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