Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tlr5Q9JLF7 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
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