Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Nifk-202ENSMUST00000112688 849 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Gm15746-201ENSMUST00000120684 1027 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
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SacsQ9JLC8 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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SacsQ9JLC8 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 6430531B16Rik-202ENSMUST00000121412 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Kcne3-206ENSMUST00000207995 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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SacsQ9JLC8 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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SacsQ9JLC8 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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SacsQ9JLC8 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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SacsQ9JLC8 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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SacsQ9JLC8 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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SacsQ9JLC8 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SacsQ9JLC8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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