Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Habp4Q9JKS5 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms