Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ45

Vmn1r46, Vomeronasal type-1 receptor 46, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r46Q9EQ45 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms