Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Med27Q9DB40 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Med27Q9DB40 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Med27Q9DB40 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Med27Q9DB40 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Med27Q9DB40 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Med27Q9DB40 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Med27Q9DB40 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Med27Q9DB40 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Med27Q9DB40 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Med27Q9DB40 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Med27Q9DB40 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Med27Q9DB40 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
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Med27Q9DB40 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Med27Q9DB40 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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