Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Phf6Q9D4J7 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Phf6Q9D4J7 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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Phf6Q9D4J7 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Phf6Q9D4J7 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Phf6Q9D4J7 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
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Phf6Q9D4J7 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Phf6Q9D4J7 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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