Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snx29Q9D3S3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms