Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXV1

Sdhd, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhdQ9CXV1 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SdhdQ9CXV1 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms