Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cnih4Q9CX13 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms