Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Chchd5Q9CQP3 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Chchd5Q9CQP3 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
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