Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

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Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rdm1Q9CQK3 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdm1Q9CQK3 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdm1Q9CQK3 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdm1Q9CQK3 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdm1Q9CQK3 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdm1Q9CQK3 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdm1Q9CQK3 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdm1Q9CQK3 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdm1Q9CQK3 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rdm1Q9CQK3 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdm1Q9CQK3 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rdm1Q9CQK3 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdm1Q9CQK3 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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Rdm1Q9CQK3 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdm1Q9CQK3 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdm1Q9CQK3 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Rdm1Q9CQK3 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Rdm1Q9CQK3 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdm1Q9CQK3 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdm1Q9CQK3 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdm1Q9CQK3 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rdm1Q9CQK3 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
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Rdm1Q9CQK3 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Rdm1Q9CQK3 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdm1Q9CQK3 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rdm1Q9CQK3 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Rdm1Q9CQK3 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Rdm1Q9CQK3 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Rdm1Q9CQK3 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdm1Q9CQK3 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Rdm1Q9CQK3 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdm1Q9CQK3 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdm1Q9CQK3 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdm1Q9CQK3 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Rdm1Q9CQK3 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdm1Q9CQK3 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdm1Q9CQK3 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdm1Q9CQK3 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rdm1Q9CQK3 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rdm1Q9CQK3 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rdm1Q9CQK3 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC15.06■□□□□ 0
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