Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Rab5aQ9CQD1 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms