Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ49

Ncbp2, Nuclear cap-binding protein subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncbp2Q9CQ49 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ncbp2Q9CQ49 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms