Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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Chmp3Q9CQ10 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Chmp3Q9CQ10 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Chmp3Q9CQ10 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Chmp3Q9CQ10 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Chmp3Q9CQ10 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Chmp3Q9CQ10 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Chmp3Q9CQ10 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Chmp3Q9CQ10 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Chmp3Q9CQ10 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Chmp3Q9CQ10 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Chmp3Q9CQ10 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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Chmp3Q9CQ10 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Chmp3Q9CQ10 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Chmp3Q9CQ10 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chmp3Q9CQ10 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Chmp3Q9CQ10 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Chmp3Q9CQ10 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Chmp3Q9CQ10 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chmp3Q9CQ10 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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