Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atg3Q9CPX6 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms