Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Bhlhe41Q99PV5 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms