Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.07■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NsmfQ99NF2 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms