Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Gm14004-201ENSMUST00000138875 590 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Mcpt4-201ENSMUST00000043249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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PtprtQ99M80 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
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PtprtQ99M80 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
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PtprtQ99M80 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtprtQ99M80 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Gm16537-201ENSMUST00000161529 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtprtQ99M80 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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