Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Tmed9Q99KF1 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmed9Q99KF1 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
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