Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nlgn1Q99K10 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms