Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Higd1bQ99JY6 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms