Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Smim11aQ99J19 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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